Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF4O60810 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms