Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11DO60235 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS11DO60235 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms