Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC2O15270 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTLC2O15270 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms