Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAD1O00515 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAD1O00515 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAD1O00515 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAD1O00515 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAD1O00515 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAD1O00515 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAD1O00515 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAD1O00515 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAD1O00515 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAD1O00515 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAD1O00515 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAD1O00515 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAD1O00515 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAD1O00515 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAD1O00515 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAD1O00515 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAD1O00515 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LAD1O00515 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LAD1O00515 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAD1O00515 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAD1O00515 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAD1O00515 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAD1O00515 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAD1O00515 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAD1O00515 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAD1O00515 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAD1O00515 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAD1O00515 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAD1O00515 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAD1O00515 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAD1O00515 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LAD1O00515 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAD1O00515 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LAD1O00515 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAD1O00515 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAD1O00515 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAD1O00515 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAD1O00515 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAD1O00515 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAD1O00515 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LAD1O00515 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LAD1O00515 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAD1O00515 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAD1O00515 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAD1O00515 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAD1O00515 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAD1O00515 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAD1O00515 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAD1O00515 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAD1O00515 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAD1O00515 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAD1O00515 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAD1O00515 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAD1O00515 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAD1O00515 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAD1O00515 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAD1O00515 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAD1O00515 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAD1O00515 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAD1O00515 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAD1O00515 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAD1O00515 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAD1O00515 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAD1O00515 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAD1O00515 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAD1O00515 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAD1O00515 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAD1O00515 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAD1O00515 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAD1O00515 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAD1O00515 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAD1O00515 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAD1O00515 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAD1O00515 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms