Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms