Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8VRH5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8VRH5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8VRH5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8VRH5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8VRH5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8VRH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8VRH5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8VRH5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8VRH5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8VRH5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8VRH5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8VRH5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8VRH5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
F8VRH5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8VRH5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8VRH5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8VRH5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8VRH5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8VRH5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8VRH5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8VRH5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8VRH5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8VRH5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8VRH5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8VRH5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8VRH5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8VRH5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8VRH5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8VRH5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8VRH5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8VRH5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8VRH5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8VRH5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8VRH5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8VRH5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8VRH5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8VRH5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8VRH5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8VRH5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8VRH5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8VRH5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8VRH5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
F8VRH5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms