Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF28PB7ZC32 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF28PB7ZC32 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms