Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49BA6NDI0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49BA6NDI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM49BA6NDI0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms