Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA3AA6NCI4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.58■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VWA3AA6NCI4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3AA6NCI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 338.6 ms