Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL33A6NCF5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL33A6NCF5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms