Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
A4D1N5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4D1N5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A4D1N5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A4D1N5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A4D1N5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A4D1N5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A4D1N5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A4D1N5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A4D1N5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A4D1N5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4D1N5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4D1N5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4D1N5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4D1N5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4D1N5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4D1N5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4D1N5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4D1N5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4D1N5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4D1N5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4D1N5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4D1N5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A4D1N5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4D1N5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4D1N5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4D1N5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4D1N5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4D1N5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4D1N5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4D1N5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4D1N5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4D1N5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4D1N5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
A4D1N5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
A4D1N5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4D1N5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms