Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PRR13-206ENST00000549135 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-213ENST00000542345 882 ntTSL 37.87□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-225ENST00000533816 540 ntTSL 522.24■■□□□ 1.152e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.082e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-202ENST00000524474 907 ntTSL 220.99■□□□□ 0.952e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-217ENST00000530452 704 ntTSL 320.5■□□□□ 0.872e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-220ENST00000531393 2304 ntTSL 1 (best)20.2■□□□□ 0.822e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-212ENST00000528770 2233 ntTSL 218.04■□□□□ 0.482e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-207ENST00000526651 572 ntTSL 417.93■□□□□ 0.462e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SLC6A8-202ENST00000413787 468 ntTSL 519.95■□□□□ 0.782e-7■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-204ENST00000463908 557 ntTSL 420.89■□□□□ 0.931e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-206ENST00000492190 738 ntTSL 319.58■□□□□ 0.721e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.11e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.071e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 25.44□□□□□ -1.541e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 34.54□□□□□ -1.681e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-214ENST00000559558 562 ntTSL 419.59■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-207ENST00000558374 731 ntTSL 37.81□□□□□ -1.164e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 36.64□□□□□ -1.358e-19■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.28□□□□□ -1.728e-19■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 528.07■■■□□ 2.082e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 228.07■■■□□ 2.082e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 527.7■■■□□ 2.032e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 526.63■■□□□ 1.852e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 324.08■■□□□ 1.452e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 223.77■■□□□ 1.42e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 523.15■■□□□ 1.32e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 319.89■□□□□ 0.772e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.482e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 516.32■□□□□ 0.22e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 315.38■□□□□ 0.052e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.03□□□□□ -0.642e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.03□□□□□ -0.642e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 510.94□□□□□ -0.662e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.972e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 MLXIPL-208ENST00000456640 706 ntTSL 519.08■□□□□ 0.645e-11■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 426.34■■□□□ 1.811e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 523.9■■□□□ 1.421e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.281e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.191e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.071e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.951e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-207ENST00000589878 559 ntTSL 420.36■□□□□ 0.851e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.481e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-205ENST00000586157 944 ntTSL 515.9■□□□□ 0.141e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-206ENST00000588522 2920 ntTSL 515.88■□□□□ 0.131e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 415.75■□□□□ 0.111e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 214.4□□□□□ -0.11e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.364e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-205ENST00000631679 778 ntTSL 512.8□□□□□ -0.361e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 212.51□□□□□ -0.411e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RPS5-208ENST00000599909 523 ntTSL 212.46□□□□□ -0.412e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 211.96□□□□□ -0.54e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC10.9□□□□□ -0.664e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.024e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-214ENST00000486515 536 ntTSL 37.64□□□□□ -1.194e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.384e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.68□□□□□ -1.821e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.174e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.044e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.134e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 GSN-211ENST00000477553 680 ntTSL 213.96□□□□□ -0.174e-13■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 511.75□□□□□ -0.534e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-202ENST00000382267 583 ntTSL 410.97□□□□□ -0.654e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.984e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 28.88□□□□□ -0.994e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 FASN-209ENST00000636628 100 ntTSL 55.16□□□□□ -1.584e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 515.7■□□□□ 0.11e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 213.91□□□□□ -0.181e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.331e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.641e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.779e-15■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-12■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-12■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-9■□□□□ 8.1
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 142 ms