RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420363.5

CPNE1-211, Transcript of copine 1, humanhuman

TSL 2

Gene CPNE1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1-211ENST00000420363 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.33■■■■■ 5.97
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CPNE1-211ENST00000420363 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.11■■■■■ 4.65
CPNE1-211ENST00000420363 NACADO15069 1562 aa43.88■■■■■ 4.61
CPNE1-211ENST00000420363 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.82■■■■■ 4.61
CPNE1-211ENST00000420363 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.65■■■■■ 4.58
CPNE1-211ENST00000420363 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.62■■■■■ 4.57
CPNE1-211ENST00000420363 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
CPNE1-211ENST00000420363 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.41■■■■■ 4.54
CPNE1-211ENST00000420363 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.29■■■■■ 4.52
CPNE1-211ENST00000420363 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.98■■■■■ 4.47
CPNE1-211ENST00000420363 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.77■■■■■ 4.44
CPNE1-211ENST00000420363 SCRIBQ14160 1630 aa42.45■■■■■ 4.39
CPNE1-211ENST00000420363 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.29■■■■■ 4.36
CPNE1-211ENST00000420363 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.87■■■■■ 4.29
CPNE1-211ENST00000420363 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.82■■■■■ 4.29
CPNE1-211ENST00000420363 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
CPNE1-211ENST00000420363 SMARCA4P51532 1647 aa40.66■■■■■ 4.1
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CPNE1-211ENST00000420363 NCAPD3P42695 1498 aa40.48■■■■■ 4.07
CPNE1-211ENST00000420363 SMARCA2P51531 1590 aa40.44■■■■■ 4.06
CPNE1-211ENST00000420363 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.42■■■■■ 4.06
CPNE1-211ENST00000420363 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.34■■■■■ 4.05
CPNE1-211ENST00000420363 HMGXB3Q12766 1538 aa40.32■■■■■ 4.04
CPNE1-211ENST00000420363 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.27■■■■■ 4.04
CPNE1-211ENST00000420363 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.12■■■■■ 4.01
CPNE1-211ENST00000420363 ERCC6Q03468 1493 aa40.12■■■■■ 4.01
CPNE1-211ENST00000420363 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
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CPNE1-211ENST00000420363 WIZO95785 1651 aa39.84■■■■□ 3.97
CPNE1-211ENST00000420363 NESP48681 1621 aa39.83■■■■□ 3.97
CPNE1-211ENST00000420363 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
CPNE1-211ENST00000420363 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.52■■■■□ 3.92
CPNE1-211ENST00000420363 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
CPNE1-211ENST00000420363 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.4■■■■□ 3.9
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CPNE1-211ENST00000420363 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.28■■■■□ 3.88
CPNE1-211ENST00000420363 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.23■■■■□ 3.87
CPNE1-211ENST00000420363 CFTRP13569 1480 aa39■■■■□ 3.83
CPNE1-211ENST00000420363 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.99■■■■□ 3.83
CPNE1-211ENST00000420363 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.92■■■■□ 3.82
CPNE1-211ENST00000420363 WDR62O43379 1518 aa38.84■■■■□ 3.81
CPNE1-211ENST00000420363 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.84■■■■□ 3.81
CPNE1-211ENST00000420363 PRDM2Q13029 1718 aa38.82■■■■□ 3.8
CPNE1-211ENST00000420363 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.8■■■■□ 3.8
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CPNE1-211ENST00000420363 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
CPNE1-211ENST00000420363 TRIM41Q8WV44 630 aa38.4■■■■□ 3.74
CPNE1-211ENST00000420363 OSCARQ8IYS5 282 aa38.3■■■■□ 3.72
CPNE1-211ENST00000420363 ABCC8Q09428 1581 aa38.19■■■■□ 3.7
CPNE1-211ENST00000420363 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.15■■■■□ 3.7
CPNE1-211ENST00000420363 TOPBP1Q92547 1522 aa38.15■■■■□ 3.7
CPNE1-211ENST00000420363 IFT140Q96RY7 1462 aa38.07■■■■□ 3.68
CPNE1-211ENST00000420363 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
CPNE1-211ENST00000420363 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
CPNE1-211ENST00000420363 CUX1P39880 1505 aa37.82■■■■□ 3.64
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CPNE1-211ENST00000420363 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.63■■■■□ 3.61
CPNE1-211ENST00000420363 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.63■■■■□ 3.61
CPNE1-211ENST00000420363 WDR97A6NE52 1622 aa37.6■■■■□ 3.61
CPNE1-211ENST00000420363 SOGA1O94964 1423 aa37.59■■■■□ 3.61
CPNE1-211ENST00000420363 FBLN2P98095 1184 aa37.58■■■■□ 3.61
CPNE1-211ENST00000420363 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.58■■■■□ 3.61
CPNE1-211ENST00000420363 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.54■■■■□ 3.6
CPNE1-211ENST00000420363 ARHGEF11O15085 1522 aa37.54■■■■□ 3.6
CPNE1-211ENST00000420363 TOP2BQ02880 1626 aa37.52■■■■□ 3.6
CPNE1-211ENST00000420363 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.52■■■■□ 3.6
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CPNE1-211ENST00000420363 SYNJ1O43426 1573 aa37.46■■■■□ 3.59
CPNE1-211ENST00000420363 CHD1O14646 1710 aa37.43■■■■□ 3.58
CPNE1-211ENST00000420363 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.42■■■■□ 3.58
CPNE1-211ENST00000420363 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.38■■■■□ 3.57
CPNE1-211ENST00000420363 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
CPNE1-211ENST00000420363 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.28■■■■□ 3.56
CPNE1-211ENST00000420363 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.27■■■■□ 3.56
CPNE1-211ENST00000420363 GRIN2BQ13224 1484 aa37.24■■■■□ 3.55
CPNE1-211ENST00000420363 PBRM1Q86U86 1689 aa37.21■■■■□ 3.55
CPNE1-211ENST00000420363 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.2■■■■□ 3.55
CPNE1-211ENST00000420363 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.54
CPNE1-211ENST00000420363 ARAP1Q96P48 1450 aa37.16■■■■□ 3.54
CPNE1-211ENST00000420363 SYNJ2O15056 1496 aa37.06■■■■□ 3.52
CPNE1-211ENST00000420363 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
CPNE1-211ENST00000420363 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.02■■■■□ 3.52
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CPNE1-211ENST00000420363 GRIN2AQ12879 1464 aa36.76■■■■□ 3.48
CPNE1-211ENST00000420363 KIF27Q86VH2 1401 aa36.75■■■■□ 3.47
CPNE1-211ENST00000420363 NUP160Q12769 1436 aa36.63■■■■□ 3.45
CPNE1-211ENST00000420363 CUL7Q14999 1698 aa36.63■■■■□ 3.45
CPNE1-211ENST00000420363 CEP170Q5SW79 1584 aa36.59■■■■□ 3.45
CPNE1-211ENST00000420363 IGF1RP08069 1367 aa36.55■■■■□ 3.44
CPNE1-211ENST00000420363 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.46■■■■□ 3.43
CPNE1-211ENST00000420363 SHROOM2Q13796 1616 aa36.41■■■■□ 3.42
CPNE1-211ENST00000420363 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.39■■■■□ 3.42
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