Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASF1AQ9Y294 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASF1AQ9Y294 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1AQ9Y294 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms