Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS5Q9UPZ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HPS5Q9UPZ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms