Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PCTPQ9UKL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCTPQ9UKL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms