Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHPKQ9UHJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPKQ9UHJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms