Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPC1L1Q9UHC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
NPC1L1Q9UHC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
NPC1L1Q9UHC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NPC1L1Q9UHC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.1 ms