Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEPT3Q9UH03 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT3Q9UH03 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms