Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GALPQ9UBC7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALPQ9UBC7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALPQ9UBC7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms