Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RBM28Q9NW13 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM28Q9NW13 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms