Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLE1Q9NVX2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLE1Q9NVX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms