Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 DUSP3-202ENST00000590342 2077 ntTSL 1 (best)15.02□□□□□ -0.014e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NFE4-201ENST00000420058 1072 ntTSL 1 (best)14.98□□□□□ -0.014e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-204ENST00000562792 542 ntTSL 414.98□□□□□ -0.014e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-208ENST00000564547 980 ntTSL 214.98□□□□□ -0.014e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-206ENST00000529265 1421 ntTSL 214.97□□□□□ -0.014e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 CDHR2-204ENST00000508085 577 ntTSL 214.66□□□□□ -0.064e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-207ENST00000580898 556 ntTSL 414.36□□□□□ -0.114e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.114e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.124e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-39■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-209ENST00000565205 1084 ntTSL 1 (best)13.79□□□□□ -0.24e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.264e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TEAD4-204ENST00000443986 641 ntTSL 313.4□□□□□ -0.264e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-217ENST00000591951 612 ntTSL 313.23□□□□□ -0.294e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.34e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.34e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NPR2-205ENST00000464810 3502 ntTSL 212.98□□□□□ -0.334e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-207ENST00000564404 915 ntTSL 312.92□□□□□ -0.344e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-202ENST00000561840 558 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.424e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-203ENST00000500625 717 ntTSL 312.29□□□□□ -0.444e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-215ENST00000625770 281 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 DUSP3-205ENST00000591618 538 ntTSL 312□□□□□ -0.494e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-211ENST00000541975 572 ntTSL 411.98□□□□□ -0.494e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NRF1-204ENST00000393230 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-14■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-201ENST00000378043 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.534e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NRF1-203ENST00000353868 3568 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.533e-14■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-203ENST00000379520 2560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-209ENST00000584620 804 ntTSL 311.43□□□□□ -0.584e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.64e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-202ENST00000416488 897 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.624e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-218ENST00000592241 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-216ENST00000588312 559 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.734e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 AC092123.1-201ENST00000565623 871 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TTC37-202ENST00000502768 917 ntTSL 310.42□□□□□ -0.744e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.754e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-206ENST00000409495 1014 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.772e-58■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-214ENST00000557244 395 ntTSL 29.96□□□□□ -0.824e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-203ENST00000553687 627 ntTSL 39.52□□□□□ -0.894e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.94e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-215ENST00000585488 575 ntTSL 39.34□□□□□ -0.914e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-207ENST00000555012 582 ntTSL 38.92□□□□□ -0.984e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-214ENST00000498242 1110 ntTSL 28.83□□□□□ -12e-58■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.014e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM245-202ENST00000413712 1973 ntTSL 28.38□□□□□ -1.074e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.084e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 28.16□□□□□ -1.14e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-208ENST00000555335 585 ntTSL 27.82□□□□□ -1.164e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.164e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.164e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-209ENST00000492439 787 ntTSL 37.66□□□□□ -1.184e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.24e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.24e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 GTF3C6-202ENST00000480191 800 ntTSL 37.18□□□□□ -1.264e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.274e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.274e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.314e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.334e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.354e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.354e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.384e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.384e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.394e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-208ENST00000490211 653 ntTSL 56.2□□□□□ -1.424e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)5.24□□□□□ -1.574e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PIGG-211ENST00000506402 2387 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 483.3
UTP3Q9NQZ2 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 483.3
UTP3Q9NQZ2 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 483.3
UTP3Q9NQZ2 AC091167.3-201ENST00000561573 3838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 483.1
UTP3Q9NQZ2 PARVB-202ENST00000402876 560 ntTSL 1 (best)20.91■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 482.8
UTP3Q9NQZ2 CDC6-203ENST00000577249 541 ntTSL 419.6■□□□□ 0.731e-53■■■■■ 482.6
UTP3Q9NQZ2 CDC6-204ENST00000580824 696 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-53■■■■■ 482.6
UTP3Q9NQZ2 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-53■■■■■ 482.6
UTP3Q9NQZ2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-11■■■■■ 482
UTP3Q9NQZ2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 482
UTP3Q9NQZ2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 482
UTP3Q9NQZ2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 482
UTP3Q9NQZ2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 482
UTP3Q9NQZ2 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 482
UTP3Q9NQZ2 WWP2-211ENST00000567986 547 ntTSL 45.64□□□□□ -1.515e-14■■■■■ 478.2
UTP3Q9NQZ2 PIGG-218ENST00000510235 752 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 478.1
UTP3Q9NQZ2 PARD3B-205ENST00000415947 1668 ntTSL 1 (best)24.81■■□□□ 1.568e-7■■■■■ 476.6
UTP3Q9NQZ2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 476.6
UTP3Q9NQZ2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 476.6
UTP3Q9NQZ2 PARD3B-201ENST00000349953 3315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 476.6
UTP3Q9NQZ2 PARD3B-202ENST00000351153 3411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 476.6
UTP3Q9NQZ2 PARD3B-203ENST00000358768 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 476.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 37.12□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 476.2
UTP3Q9NQZ2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.918e-7■■■■■ 475.7
UTP3Q9NQZ2 KSR1-217ENST00000583370 1041 ntTSL 318.34■□□□□ 0.538e-7■■■■■ 475.7
UTP3Q9NQZ2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 475.7
UTP3Q9NQZ2 KSR1-215ENST00000582311 693 ntTSL 215.14■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 475.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3656.4 ms