Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB3Q9NQW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB3Q9NQW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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