Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR4Q9NPB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms