Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6AQ9NPB6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARD6AQ9NPB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms