Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA1Q9NP55 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA1Q9NP55 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA1Q9NP55 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms