Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP29Q9HBJ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP29Q9HBJ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms