Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDFQ9HBH1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDFQ9HBH1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDFQ9HBH1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms