Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUGCTQ9HAC7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SUGCTQ9HAC7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms