Protein–RNA interactions for Protein: Q9H334

FOXP1, Forkhead box protein P1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP1Q9H334 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP1Q9H334 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP1Q9H334 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FOXP1Q9H334 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXP1Q9H334 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXP1Q9H334 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXP1Q9H334 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXP1Q9H334 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXP1Q9H334 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms