Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGIF2Q9GZN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGIF2Q9GZN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TGIF2Q9GZN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms