Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRXQ9BXM0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRXQ9BXM0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRXQ9BXM0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRXQ9BXM0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms