Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM14BQ9BX40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LSM14BQ9BX40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms