Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUSC1Q9BVN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUSC1Q9BVN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUSC1Q9BVN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUSC1Q9BVN2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms