Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC3Q9BQ90 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC3Q9BQ90 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC3Q9BQ90 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms