Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSRNP1Q96S65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP1Q96S65 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms