Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX18Q96RF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX18Q96RF0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX18Q96RF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms