Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPDC7Q96QD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC7Q96QD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms