Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS50Q96JG6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms