Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.4 ms