Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA7LQ96GN5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA7LQ96GN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CDCA7LQ96GN5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDCA7LQ96GN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms