Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IMP4Q96G21 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IMP4Q96G21 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms