Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms