Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP4Q969X6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms