Protein–RNA interactions for Protein: Q92615

LARP4B, La-related protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4BQ92615 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP4BQ92615 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP4BQ92615 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP4BQ92615 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms