Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF3Q92576 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms