Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BBXQ8WY36 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BBXQ8WY36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBXQ8WY36 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BBXQ8WY36 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BBXQ8WY36 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BBXQ8WY36 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BBXQ8WY36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BBXQ8WY36 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BBXQ8WY36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BBXQ8WY36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BBXQ8WY36 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BBXQ8WY36 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BBXQ8WY36 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BBXQ8WY36 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
BBXQ8WY36 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BBXQ8WY36 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBXQ8WY36 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBXQ8WY36 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BBXQ8WY36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBXQ8WY36 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BBXQ8WY36 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BBXQ8WY36 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms