Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASKIN2Q8WXE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASKIN2Q8WXE0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms