Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZCCHC13Q8WW36 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZCCHC13Q8WW36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms